1982 yılında, uzayın derinliklerinde yaşam mücadelesi veren son uzaylılar, Dünya’da yeni bir başlangıç yapmaya karar verirler. Güney Afrika’nın ıssız bir bölgesine yerleşen bu yabancılar, kısa sürede MNU adlı dev bir şirketin radarına yakalanır. Şirket, uzaylıların ileri teknolojik bilgisini ele geçirerek büyük bir servet elde etmeyi amaçlar ve bu yüzden onları District 9 adı verilen kapalı bir bölgeye hapseder. Ancak MNU’nun planları, sıradan bir çalışan olan Wikus van der Merwe’nin gizemli bir virüse maruz kalmasıyla bozulur. Merwe, yavaş yavaş bir uzaylıya dönüşmeye başlar ve bu durum onu hem MNU’nun hem de insanların hedefi haline getirir. Hayatta kalmak için District 9’a sığınan Merwe, burada insanlığın en karanlık yönleriyle yüzleşir. Bu süreçte, hem kendi varlığını korumak hem de iki dünya arasında bir denge kurmak zorundadır.