17 yaşındaki Codename 13, karmaşık yaşamının iplerini bir kez daha çözmeye hazırlanıyor. Suikast sanatında gösterdiği mükemmel ustalık ile Gölge adlı gizli suikast kolektifinin en değerli elemanlarından biri haline gelen 13, Japonya’daki bir görevde yaşadığı talihsiz bir olay sonucunda akıl hocası Umbra tarafından Endonezya’nın Cakarta şehrine sürgün edilir. Cakarta’da, annesini acımasız bir suç çetesi tarafından kaçırılmış olan 11 yaşındaki Monji ile tanışır. Monji’nin hayatta kalma mücadelesi, 13’ün içindeki bastırılmış vicdanı uyandırır ve ikisi arasında güçlü bir bağ kurulur. Ancak Monji aniden kaybolduğunda, 13, onu kurtarmak için harekete geçmek zorundadır. Bu karar, yalnızca suç örgütlerine karşı bir savaş açmak değil, aynı zamanda onu büyüten Gölge’ye ve akıl hocası Umbra’ya karşı da bir başkaldırıdır. Artık, önüne çıkan her engeli acımasızca yıkmaya kararlıdır. Kendi karanlık geçmişiyle yüzleşirken, Monji’yi kurtarmak için tüm fedakarlıkları göze alacak ve yaşamındaki en zorlu mücadeleyi vermeye hazırdır. Hayatını kurtarmak uğruna her türlü riski almaya istekli bir şekilde, karanlık bir dünyada ilerleyecektir.