Çin’in Kültür Devrimi’nin karanlık gölgesinde, bilim ve ihanetin kesiştiği bir savaş başlamaktadır. Gizli bir askeri proje, uzaylı yaşam formlarıyla iletişim kurma amacıyla evrene özel sinyaller göndermeye başlar. Bu sinyaller, Trisolaris adında, yok olmak üzere olan bir gezegene ulaşır. Trisolarisliler, Dünya’yı kurtuluş umudu olarak görür ve işgal planı yaparak yola koyulurlar.
Dünya’da ise uzaylıların gelişine karşı farklı gruplar oluşmaya başlar. Bilim insanları, uzaylılarla iletişim kurarak barışçıl bir çözüm bulmaya çalışırken, bir grup insan ise işgalcilere karşı koymak için silahlanır. Bu karmaşık ortamda ihanet de devreye girer ve bazı insanlar, kişisel çıkarları için insanlığı satmaya hazır hale gelir.
3 Cisim Problemi, bilim kurgu ve distopya türlerini harmanlayan bir dizi olarak karşımıza çıkıyor. Hikaye, bilimsel keşiflerin karanlık yüzünü ve insanlığın en zor anlarında ortaya çıkan ihanetleri gözler önüne seriyor. Dizi, izleyicileri insanlığın varoluş mücadelesine ortak ederek, etik ve ahlaki sorgulamalara sürüklüyor.